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NGS接頭暗語

NGS接頭暗語

近些年來,測序儀型號更迭,不斷刷新測序通量的紀錄。變的是越來越高的測序通量,不變的是Illumina的多樣本混合上機和文庫構建策略。 每個樣本在文庫構建中都帶上了獨特的“號碼牌”,這便是混合上機后,生信工程師數據分析時的“接頭暗語”。在“茫茫reads海”幫助“目標樣本”找到屬于自己的那個“她”。因此,“接頭暗語”也隨著測序儀器型號的更新而升級。

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正本清源—TruGrade? Oligo護航你的高靈敏度檢驗

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如何讓真實世界的污染不干擾你“草垛尋針”?

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“超低頻假陽性突變”這件小事

“超低頻假陽性突變”這件小事

上篇文章《NGS接頭暗語》中,我們介紹了數種帶有樣本標簽和分子標簽的Illumina Y型接頭策略。接頭的拆分一直是大家關注的重點。除了IDT推薦的工作流程和Github開源的軟件包以外,國內的研究者近期也開發出了新型工具。

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高通量測序平臺中,一個全能接頭的“自我修養”

高通量測序平臺中,一個全能接頭的“自我修養”

上篇《樣本先生,您帶錯帽子了!》結尾,我們提到了“一個優秀index的自我修養”,其中包括生產過程的準確性,針對平臺的優化,和考慮index的容錯性等方面。現在我們就來談談,在實際的建庫過程中使用的DNA片段鏈接的接頭(adapter),需要具備哪些要素?

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